第一二集内容：King Sombra曾经统治小马国边缘的水晶王国，带来了无尽的苦难。后来他被塞拉斯迪亚公主和露娜公主联合击败，变成阴影，并被放逐。一千年后，King Sombra卷土重来，想要重新统治水晶王国。大公主希望暮光闪闪(twilight sparkle)一行去保护水晶王国，免受King Sombra的再度袭击。他们克服重重困难和阻挠，去保护水晶王国，并让那里再度恢复生机。第三季的制作团队基本保留了第二季的结构，劳伦浮士德依然退出。了解更多中文小马资讯可以关注：EquetriaCN新浪博客MLP:FiM是什么？小马迷是什么？——参考第一季剧情简介

While still trying to adjust to her new role as the Princess of Friendship, Twilight and friends follow a map to a village where the inhabitants mysteriously have no talents and are equal in every way.

因和女友洛萍·哈瑞斯（莱丝莉·曼LeslieMann饰）发生不快，房地产经营上史蒂夫·考维克斯（马修·布鲁德里克MatthewBroderick饰）被迫搬到一幢新的公寓。不久，有线电视安装人员杜哲（吉姆·凯瑞JimCarrey饰）登门拜访。杜哲举止乖张，为人却颇为幽默开朗。两人由此成为好朋友，更相约外出游玩。在杜哲的指点下，史蒂夫成功赢回女友的芳心。然而杜哲似乎过于热情，他越来越多介入到史蒂夫的生活当中，令后者渐感烦躁和不安。史蒂夫开始有意识地远离这个不太正常的家伙，感觉被好友抛弃的杜哲由此暗升报复之心……本片荣获1997年儿童选择奖最受欢迎男主角奖（JimCarrey）。

一天晚上,比宝因为思念素素做了一个素素的娃娃,结果弄坏了。爱丽娜知道后，为了鼓励它，给它讲了蝴蝶仙子的故事：曼瑞莎是一个蝴蝶仙子，她有一个好朋友薇拉和两个双胞胎姐姐。一天，她收到王子的一张地图，要她去圣地寻找拯救女王的方法。于是她和两个姐姐出发了。与此同时，薇拉发现女王被坏仙子汉娜下了毒，于是救出被软禁的王子，并揭发了汉娜。随后曼瑞莎得到了R30;一天晚上,比宝因为思念素素做了一个素素的娃娃,结果弄坏了。爱丽娜知道后，为了鼓励它，给它讲了蝴蝶仙子的故事：曼瑞莎是一个蝴蝶仙子，她有一个好朋友薇拉和两个双胞胎姐姐。一天，她收到王子的一张地图，要她去圣地寻找拯救女王的方法。于是她和两个姐姐出发了。与此同时，薇拉发现女王被坏仙子汉娜下了毒，于是救出被软禁的王子，并揭发了汉娜。随后曼瑞莎得到了救女王的神奇花朵，回到了Flutterfield（蝴蝶仙子们的家），并用花朵救了女王。使汉娜得到应有的下场。最后，女王把荣誉花环送给了玛丽坡莎等人。感谢她们拯救了Flutterfield。